В городе занимаются производством горного оборудования: в Магадане находится машиностроительный завод и ремонтно-механический завод, на котором разрабатывают и выпускают тяжёлую горную технику и запчасти к ней. Также функционирует ряд крупных производств по переработке рыбы.