Градообразующими предприятиями Истры называют ФГУП «НПП ВНИИЭМ» и ВНИИЭТО. Первый научно-исследовательский институт специализируются на системах управления и защиты для атомных электростанций, проектировании и производстве метеорологических спутников, а ВНИИЭТО — на электротермическом оборудовании. Другими значимыми производствами города являются швейная фабрика, мебельные производства, специализирующиеся на изготовлении корпусной, офисной и медицинской мебели, заводы по производству кирпича и керамики, предприятие «Рентгенпром», на котором занимаются изготовлением рентгеновской техники.