Экономика города основывается на портовом хозяйстве, судоремонтной деятельности и пищевой промышленности. Ведущее промышленное предприятие Балтийска — судоремонтный завод — занимается обслуживанием и ремонтом военных, гражданских судов не только нашей страны, но и иностранных государств.