Город считается крупным промышленным и научным центром Алтайского края, имеет статус наукограда. Бийск — признанный лидер по производству фармацевтической продукции в крае, крупнейшим предприятием данной отрасли в регионе является компания «Алтайвитамины». В городе налажено и производство паровых и водонагревательных котлов. Химическая отрасль представлена заводами по производству лаков и эмалей, серной кислоты. В состав производственного комплекса Бийска входят оборонные предприятия госкорпорации «Ростех», к числу которых относится БПО Сибприбормаш».